万县中医药学校坐落在举世闻名的长江三峡库区腹心——重庆市万州区。万州位于中国东西部连接带的中心点，素有“川东门户”之称，自古以来，就是川东、渝东、鄂西、黔东北的物资集散中心和水陆交通枢纽，是长江十大港口城市之一。