学校是2000年7月经湖南省人民政府批准教育部备案，由零陵卫校和零陵农校合并升格而成。2003年6月经湖南省人民政府批准，将原零陵商校、零陵工校、零陵师范三所普通中专成建制并入永州职业技术学院。2010年，学院顺利通过国家示范性高等职业院校验收。2016年8月，入选第二批国家现代学徒制试点单位。