巢湖市第二中学创办于1947年，前身是解放前的私立皖光中学和黄山初中，1952年两校合并为公办巢县初中，1960年增设高中部，更名为巢县第二中学，1984年又更名为巢湖市第二中学，2005年，学校被安徽省教育厅命名为“安徽省示范高中”。